Protein–RNA interactions for Protein: P70348

Gcm1, Chorion-specific transcription factor GCMa, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm1P70348 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gcm1P70348 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcm1P70348 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcm1P70348 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcm1P70348 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcm1P70348 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcm1P70348 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcm1P70348 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcm1P70348 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcm1P70348 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcm1P70348 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcm1P70348 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcm1P70348 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcm1P70348 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcm1P70348 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcm1P70348 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcm1P70348 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcm1P70348 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcm1P70348 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcm1P70348 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gcm1P70348 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gcm1P70348 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms