Protein–RNA interactions for Protein: P70284

Tgif1, Homeobox protein TGIF1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif1P70284 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgif1P70284 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgif1P70284 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms