Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Sycp3P70281 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Sycp3P70281 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms