Protein–RNA interactions for Protein: P70270

Rad54l, DNA repair and recombination protein RAD54-like, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54lP70270 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rad54lP70270 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rad54lP70270 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rad54lP70270 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad54lP70270 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad54lP70270 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad54lP70270 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad54lP70270 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad54lP70270 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad54lP70270 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad54lP70270 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad54lP70270 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad54lP70270 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad54lP70270 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad54lP70270 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rad54lP70270 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms