Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tubb4bP68372 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tubb4bP68372 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms