Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps17P63276 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps17P63276 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rps17P63276 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps17P63276 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps17P63276 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps17P63276 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rps17P63276 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms