Protein–RNA interactions for Protein: P62812

Gabra1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra1P62812 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gabra1P62812 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gabra1P62812 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1701.6 ms