Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hpcal1P62748 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hpcal1P62748 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms