Protein–RNA interactions for Protein: P62746

Rhob, Rho-related GTP-binding protein RhoB, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhobP62746 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhobP62746 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhobP62746 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhobP62746 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhobP62746 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhobP62746 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhobP62746 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhobP62746 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhobP62746 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhobP62746 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhobP62746 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhobP62746 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhobP62746 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhobP62746 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RhobP62746 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhobP62746 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhobP62746 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhobP62746 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhobP62746 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhobP62746 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhobP62746 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhobP62746 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhobP62746 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhobP62746 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RhobP62746 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhobP62746 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhobP62746 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhobP62746 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhobP62746 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhobP62746 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhobP62746 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhobP62746 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhobP62746 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhobP62746 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhobP62746 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhobP62746 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhobP62746 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RhobP62746 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RhobP62746 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RhobP62746 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RhobP62746 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RhobP62746 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RhobP62746 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RhobP62746 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhobP62746 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhobP62746 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RhobP62746 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhobP62746 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RhobP62746 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhobP62746 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RhobP62746 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhobP62746 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhobP62746 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhobP62746 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhobP62746 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhobP62746 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhobP62746 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhobP62746 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhobP62746 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RhobP62746 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RhobP62746 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhobP62746 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RhobP62746 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhobP62746 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhobP62746 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhobP62746 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RhobP62746 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RhobP62746 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RhobP62746 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhobP62746 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RhobP62746 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhobP62746 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RhobP62746 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhobP62746 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhobP62746 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RhobP62746 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RhobP62746 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhobP62746 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhobP62746 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhobP62746 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhobP62746 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhobP62746 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RhobP62746 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RhobP62746 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RhobP62746 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RhobP62746 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhobP62746 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RhobP62746 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhobP62746 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RhobP62746 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhobP62746 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RhobP62746 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhobP62746 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RhobP62746 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhobP62746 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RhobP62746 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhobP62746 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhobP62746 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RhobP62746 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RhobP62746 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms