Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf6P62331 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf6P62331 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf6P62331 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf6P62331 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf6P62331 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf6P62331 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arf6P62331 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Arf6P62331 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Arf6P62331 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms