Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps29P62274 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Rps29P62274 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps29P62274 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps29P62274 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps29P62274 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps29P62274 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps29P62274 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps29P62274 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rps29P62274 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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