Protein–RNA interactions for Protein: P62046

Lrch1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch1P62046 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrch1P62046 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrch1P62046 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrch1P62046 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms