Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sem1P60897 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sem1P60897 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sem1P60897 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sem1P60897 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sem1P60897 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sem1P60897 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms