Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rims4P60191 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rims4P60191 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims4P60191 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rims4P60191 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims4P60191 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims4P60191 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims4P60191 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rims4P60191 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms