Protein–RNA interactions for Protein: P59383

Lrrn4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, mousemouse

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Length 733 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4P59383 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrn4P59383 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Lrrn4P59383 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrn4P59383 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms