Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CgnP59242 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CgnP59242 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CgnP59242 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CgnP59242 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CgnP59242 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CgnP59242 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CgnP59242 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CgnP59242 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CgnP59242 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CgnP59242 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CgnP59242 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CgnP59242 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CgnP59242 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CgnP59242 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CgnP59242 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CgnP59242 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CgnP59242 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CgnP59242 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CgnP59242 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CgnP59242 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CgnP59242 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CgnP59242 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CgnP59242 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CgnP59242 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CgnP59242 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CgnP59242 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CgnP59242 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CgnP59242 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CgnP59242 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CgnP59242 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CgnP59242 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CgnP59242 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CgnP59242 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CgnP59242 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CgnP59242 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CgnP59242 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CgnP59242 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CgnP59242 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CgnP59242 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CgnP59242 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CgnP59242 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CgnP59242 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CgnP59242 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CgnP59242 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CgnP59242 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CgnP59242 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CgnP59242 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CgnP59242 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CgnP59242 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CgnP59242 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CgnP59242 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CgnP59242 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CgnP59242 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CgnP59242 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CgnP59242 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CgnP59242 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CgnP59242 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CgnP59242 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CgnP59242 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CgnP59242 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CgnP59242 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CgnP59242 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CgnP59242 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CgnP59242 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CgnP59242 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CgnP59242 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CgnP59242 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CgnP59242 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CgnP59242 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CgnP59242 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CgnP59242 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CgnP59242 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CgnP59242 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CgnP59242 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CgnP59242 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CgnP59242 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CgnP59242 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CgnP59242 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CgnP59242 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CgnP59242 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CgnP59242 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CgnP59242 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CgnP59242 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CgnP59242 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CgnP59242 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CgnP59242 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CgnP59242 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CgnP59242 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CgnP59242 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CgnP59242 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CgnP59242 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CgnP59242 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CgnP59242 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CgnP59242 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CgnP59242 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CgnP59242 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CgnP59242 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CgnP59242 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CgnP59242 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms