Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Nphp4P59240 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nphp4P59240 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nphp4P59240 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms