Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdsp1P58466 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ctdsp1P58466 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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