Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Uchl4P58321 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uchl4P58321 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uchl4P58321 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uchl4P58321 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Uchl4P58321 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl4P58321 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl4P58321 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl4P58321 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl4P58321 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl4P58321 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl4P58321 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl4P58321 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl4P58321 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl4P58321 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl4P58321 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl4P58321 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Uchl4P58321 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Uchl4P58321 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uchl4P58321 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uchl4P58321 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uchl4P58321 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uchl4P58321 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uchl4P58321 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uchl4P58321 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Uchl4P58321 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Uchl4P58321 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uchl4P58321 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uchl4P58321 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uchl4P58321 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uchl4P58321 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uchl4P58321 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uchl4P58321 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Uchl4P58321 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uchl4P58321 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uchl4P58321 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uchl4P58321 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uchl4P58321 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Uchl4P58321 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms