Protein–RNA interactions for Protein: P58021

Tm9sf2, Transmembrane 9 superfamily member 2, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf2P58021 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tm9sf2P58021 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tm9sf2P58021 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms