Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NcstnP57716 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NcstnP57716 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NcstnP57716 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NcstnP57716 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NcstnP57716 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NcstnP57716 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NcstnP57716 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NcstnP57716 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NcstnP57716 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NcstnP57716 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NcstnP57716 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NcstnP57716 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NcstnP57716 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NcstnP57716 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NcstnP57716 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NcstnP57716 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms