Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TdgP56581 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TdgP56581 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TdgP56581 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TdgP56581 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TdgP56581 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TdgP56581 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TdgP56581 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TdgP56581 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TdgP56581 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TdgP56581 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TdgP56581 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TdgP56581 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TdgP56581 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TdgP56581 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TdgP56581 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TdgP56581 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TdgP56581 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TdgP56581 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TdgP56581 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TdgP56581 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TdgP56581 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TdgP56581 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TdgP56581 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TdgP56581 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TdgP56581 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TdgP56581 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TdgP56581 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TdgP56581 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TdgP56581 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TdgP56581 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TdgP56581 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TdgP56581 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TdgP56581 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TdgP56581 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TdgP56581 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TdgP56581 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TdgP56581 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TdgP56581 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TdgP56581 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TdgP56581 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TdgP56581 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TdgP56581 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TdgP56581 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TdgP56581 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TdgP56581 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TdgP56581 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TdgP56581 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TdgP56581 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TdgP56581 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TdgP56581 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TdgP56581 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TdgP56581 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TdgP56581 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TdgP56581 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TdgP56581 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TdgP56581 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TdgP56581 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TdgP56581 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TdgP56581 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TdgP56581 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TdgP56581 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TdgP56581 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TdgP56581 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TdgP56581 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TdgP56581 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TdgP56581 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TdgP56581 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TdgP56581 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TdgP56581 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TdgP56581 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TdgP56581 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TdgP56581 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TdgP56581 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TdgP56581 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TdgP56581 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TdgP56581 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TdgP56581 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TdgP56581 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TdgP56581 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TdgP56581 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TdgP56581 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TdgP56581 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TdgP56581 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TdgP56581 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TdgP56581 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TdgP56581 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TdgP56581 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TdgP56581 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TdgP56581 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TdgP56581 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TdgP56581 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TdgP56581 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TdgP56581 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TdgP56581 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TdgP56581 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TdgP56581 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TdgP56581 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TdgP56581 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TdgP56581 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms