Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Sh3bp1P55194 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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Sh3bp1P55194 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sh3bp1P55194 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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