Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rad23aP54726 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rad23aP54726 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rad23aP54726 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms