Protein–RNA interactions for Protein: P53395

Dbt, Lipoamide acyltransferase component of branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase complex, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbtP53395 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DbtP53395 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DbtP53395 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
DbtP53395 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DbtP53395 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DbtP53395 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DbtP53395 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DbtP53395 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DbtP53395 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
DbtP53395 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DbtP53395 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DbtP53395 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
DbtP53395 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DbtP53395 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DbtP53395 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DbtP53395 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
DbtP53395 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DbtP53395 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DbtP53395 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DbtP53395 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
DbtP53395 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DbtP53395 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
DbtP53395 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DbtP53395 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DbtP53395 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DbtP53395 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DbtP53395 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DbtP53395 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DbtP53395 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DbtP53395 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DbtP53395 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DbtP53395 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DbtP53395 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DbtP53395 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DbtP53395 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DbtP53395 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DbtP53395 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DbtP53395 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
DbtP53395 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
DbtP53395 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DbtP53395 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DbtP53395 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DbtP53395 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DbtP53395 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DbtP53395 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DbtP53395 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DbtP53395 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DbtP53395 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DbtP53395 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DbtP53395 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DbtP53395 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
DbtP53395 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DbtP53395 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DbtP53395 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
DbtP53395 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
DbtP53395 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DbtP53395 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DbtP53395 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DbtP53395 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
DbtP53395 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
DbtP53395 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DbtP53395 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
DbtP53395 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DbtP53395 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DbtP53395 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DbtP53395 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DbtP53395 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DbtP53395 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DbtP53395 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DbtP53395 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DbtP53395 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DbtP53395 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbtP53395 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbtP53395 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DbtP53395 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbtP53395 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbtP53395 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbtP53395 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbtP53395 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbtP53395 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbtP53395 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbtP53395 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbtP53395 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbtP53395 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbtP53395 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbtP53395 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbtP53395 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbtP53395 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbtP53395 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbtP53395 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DbtP53395 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DbtP53395 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DbtP53395 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DbtP53395 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DbtP53395 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DbtP53395 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DbtP53395 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DbtP53395 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DbtP53395 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DbtP53395 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms