Protein–RNA interactions for Protein: P52927

Hmga2, High mobility group protein HMGI-C, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga2P52927 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmga2P52927 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga2P52927 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga2P52927 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga2P52927 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga2P52927 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga2P52927 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga2P52927 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga2P52927 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga2P52927 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga2P52927 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga2P52927 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga2P52927 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga2P52927 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmga2P52927 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms