Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efnb1P52795 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Efnb1P52795 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms