Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gpc4P51655 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gpc4P51655 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms