Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tnnt2P50752 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt2P50752 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnnt2P50752 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnnt2P50752 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt2P50752 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt2P50752 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt2P50752 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt2P50752 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt2P50752 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt2P50752 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt2P50752 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt2P50752 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt2P50752 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt2P50752 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt2P50752 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt2P50752 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms