Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa8P50706 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa8P50706 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa8P50706 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa8P50706 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa8P50706 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa8P50706 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa8P50706 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa8P50706 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Defa8P50706 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa8P50706 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa8P50706 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa8P50706 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa8P50706 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms