Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hoxc13P50207 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Hoxc13P50207 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms