Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CtshP49935 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtshP49935 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtshP49935 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CtshP49935 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtshP49935 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtshP49935 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtshP49935 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtshP49935 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtshP49935 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtshP49935 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtshP49935 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtshP49935 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtshP49935 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtshP49935 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtshP49935 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtshP49935 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtshP49935 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtshP49935 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtshP49935 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CtshP49935 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtshP49935 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtshP49935 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtshP49935 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CtshP49935 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtshP49935 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtshP49935 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtshP49935 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtshP49935 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtshP49935 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtshP49935 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtshP49935 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtshP49935 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CtshP49935 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtshP49935 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtshP49935 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtshP49935 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CtshP49935 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CtshP49935 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CtshP49935 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CtshP49935 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CtshP49935 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtshP49935 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtshP49935 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtshP49935 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtshP49935 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtshP49935 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtshP49935 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtshP49935 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtshP49935 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtshP49935 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtshP49935 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtshP49935 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtshP49935 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CtshP49935 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CtshP49935 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtshP49935 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtshP49935 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtshP49935 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtshP49935 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtshP49935 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtshP49935 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtshP49935 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtshP49935 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtshP49935 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtshP49935 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtshP49935 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtshP49935 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtshP49935 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtshP49935 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtshP49935 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtshP49935 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtshP49935 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtshP49935 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtshP49935 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtshP49935 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtshP49935 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtshP49935 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtshP49935 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtshP49935 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtshP49935 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtshP49935 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CtshP49935 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CtshP49935 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtshP49935 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtshP49935 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtshP49935 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtshP49935 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtshP49935 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtshP49935 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtshP49935 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CtshP49935 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtshP49935 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtshP49935 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtshP49935 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CtshP49935 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CtshP49935 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtshP49935 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtshP49935 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CtshP49935 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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