Protein–RNA interactions for Protein: P49582

Chrna7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna7P49582 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Chrna7P49582 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Chrna7P49582 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms