Protein–RNA interactions for Protein: P48377

Rfx1, MHC class II regulatory factor RFX1, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx1P48377 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rfx1P48377 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rfx1P48377 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms