Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VdrP48281 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
VdrP48281 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VdrP48281 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VdrP48281 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VdrP48281 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VdrP48281 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VdrP48281 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VdrP48281 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VdrP48281 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VdrP48281 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VdrP48281 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VdrP48281 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
VdrP48281 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
VdrP48281 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
VdrP48281 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
VdrP48281 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VdrP48281 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VdrP48281 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VdrP48281 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VdrP48281 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VdrP48281 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VdrP48281 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
VdrP48281 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VdrP48281 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
VdrP48281 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VdrP48281 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VdrP48281 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VdrP48281 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VdrP48281 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VdrP48281 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VdrP48281 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VdrP48281 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VdrP48281 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VdrP48281 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VdrP48281 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VdrP48281 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
VdrP48281 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VdrP48281 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
VdrP48281 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
VdrP48281 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VdrP48281 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VdrP48281 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VdrP48281 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VdrP48281 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VdrP48281 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VdrP48281 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VdrP48281 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VdrP48281 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VdrP48281 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VdrP48281 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VdrP48281 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VdrP48281 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
VdrP48281 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VdrP48281 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VdrP48281 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
VdrP48281 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
VdrP48281 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VdrP48281 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VdrP48281 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VdrP48281 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VdrP48281 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VdrP48281 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VdrP48281 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VdrP48281 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VdrP48281 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VdrP48281 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VdrP48281 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VdrP48281 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VdrP48281 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VdrP48281 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VdrP48281 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VdrP48281 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VdrP48281 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VdrP48281 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VdrP48281 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VdrP48281 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VdrP48281 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VdrP48281 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VdrP48281 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VdrP48281 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VdrP48281 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VdrP48281 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VdrP48281 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VdrP48281 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VdrP48281 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VdrP48281 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VdrP48281 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VdrP48281 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VdrP48281 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VdrP48281 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VdrP48281 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VdrP48281 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VdrP48281 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VdrP48281 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VdrP48281 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VdrP48281 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VdrP48281 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
VdrP48281 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VdrP48281 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms