Protein–RNA interactions for Protein: P46737

Brcc3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brcc3P46737 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brcc3P46737 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Brcc3P46737 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms