Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cdkn1bP46414 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms