Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tlx1P43345 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tlx1P43345 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms