Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rpl28P41105 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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