Protein–RNA interactions for Protein: P40749

Syt4, Synaptotagmin-4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt4P40749 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt4P40749 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt4P40749 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt4P40749 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt4P40749 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt4P40749 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt4P40749 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt4P40749 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syt4P40749 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Syt4P40749 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms