Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ThpoP40226 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ThpoP40226 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ThpoP40226 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ThpoP40226 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ThpoP40226 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ThpoP40226 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ThpoP40226 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ThpoP40226 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ThpoP40226 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms