Protein–RNA interactions for Protein: P39876

Timp3, Metalloproteinase inhibitor 3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp3P39876 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Timp3P39876 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp3P39876 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp3P39876 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp3P39876 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp3P39876 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp3P39876 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp3P39876 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp3P39876 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp3P39876 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Timp3P39876 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms