Protein–RNA interactions for Protein: P39688

Fyn, Tyrosine-protein kinase Fyn, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FynP39688 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FynP39688 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FynP39688 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FynP39688 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FynP39688 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FynP39688 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FynP39688 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FynP39688 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FynP39688 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FynP39688 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FynP39688 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FynP39688 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FynP39688 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FynP39688 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
FynP39688 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
FynP39688 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FynP39688 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FynP39688 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FynP39688 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FynP39688 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
FynP39688 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FynP39688 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
FynP39688 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FynP39688 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FynP39688 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FynP39688 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FynP39688 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
FynP39688 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FynP39688 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FynP39688 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FynP39688 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FynP39688 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FynP39688 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
FynP39688 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
FynP39688 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FynP39688 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FynP39688 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FynP39688 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FynP39688 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FynP39688 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FynP39688 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FynP39688 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FynP39688 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FynP39688 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FynP39688 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FynP39688 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
FynP39688 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FynP39688 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
FynP39688 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
FynP39688 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FynP39688 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FynP39688 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
FynP39688 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
FynP39688 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FynP39688 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FynP39688 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FynP39688 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FynP39688 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FynP39688 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FynP39688 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FynP39688 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FynP39688 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FynP39688 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FynP39688 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FynP39688 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FynP39688 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FynP39688 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FynP39688 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FynP39688 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FynP39688 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FynP39688 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FynP39688 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FynP39688 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FynP39688 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FynP39688 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FynP39688 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FynP39688 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FynP39688 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FynP39688 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FynP39688 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FynP39688 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FynP39688 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FynP39688 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FynP39688 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FynP39688 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FynP39688 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FynP39688 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FynP39688 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FynP39688 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FynP39688 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FynP39688 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FynP39688 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FynP39688 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FynP39688 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FynP39688 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FynP39688 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FynP39688 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FynP39688 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FynP39688 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FynP39688 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms