Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upk2P38575 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upk2P38575 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Upk2P38575 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upk2P38575 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upk2P38575 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upk2P38575 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upk2P38575 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upk2P38575 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upk2P38575 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upk2P38575 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upk2P38575 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upk2P38575 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upk2P38575 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Upk2P38575 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Upk2P38575 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upk2P38575 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upk2P38575 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upk2P38575 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk2P38575 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk2P38575 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk2P38575 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Upk2P38575 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms