Protein–RNA interactions for Protein: P35545

Fau, Ubiquitin-like protein FUBI, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FauP35545 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FauP35545 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FauP35545 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FauP35545 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FauP35545 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FauP35545 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FauP35545 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FauP35545 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FauP35545 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FauP35545 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FauP35545 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FauP35545 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FauP35545 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FauP35545 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FauP35545 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FauP35545 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FauP35545 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FauP35545 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FauP35545 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FauP35545 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FauP35545 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FauP35545 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FauP35545 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FauP35545 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FauP35545 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FauP35545 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FauP35545 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FauP35545 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FauP35545 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FauP35545 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FauP35545 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FauP35545 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FauP35545 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FauP35545 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FauP35545 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FauP35545 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FauP35545 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FauP35545 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FauP35545 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FauP35545 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FauP35545 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FauP35545 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FauP35545 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FauP35545 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FauP35545 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FauP35545 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FauP35545 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FauP35545 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FauP35545 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FauP35545 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FauP35545 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FauP35545 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FauP35545 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FauP35545 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FauP35545 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FauP35545 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FauP35545 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FauP35545 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FauP35545 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FauP35545 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FauP35545 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FauP35545 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FauP35545 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FauP35545 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FauP35545 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FauP35545 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FauP35545 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FauP35545 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FauP35545 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FauP35545 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FauP35545 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FauP35545 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FauP35545 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FauP35545 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FauP35545 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FauP35545 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FauP35545 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FauP35545 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FauP35545 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FauP35545 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FauP35545 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FauP35545 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FauP35545 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FauP35545 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FauP35545 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FauP35545 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FauP35545 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FauP35545 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FauP35545 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FauP35545 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FauP35545 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FauP35545 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FauP35545 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FauP35545 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FauP35545 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FauP35545 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FauP35545 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FauP35545 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FauP35545 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FauP35545 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms