Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin1P35438 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin1P35438 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin1P35438 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin1P35438 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Grin1P35438 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Grin1P35438 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Grin1P35438 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Grin1P35438 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Grin1P35438 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Grin1P35438 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Grin1P35438 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin1P35438 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin1P35438 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin1P35438 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin1P35438 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin1P35438 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin1P35438 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin1P35438 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Grin1P35438 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Grin1P35438 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin1P35438 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin1P35438 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin1P35438 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Grin1P35438 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Grin1P35438 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms