Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PpardP35396 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PpardP35396 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PpardP35396 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PpardP35396 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PpardP35396 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PpardP35396 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PpardP35396 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PpardP35396 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PpardP35396 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PpardP35396 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PpardP35396 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PpardP35396 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PpardP35396 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PpardP35396 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PpardP35396 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PpardP35396 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PpardP35396 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PpardP35396 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PpardP35396 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PpardP35396 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PpardP35396 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PpardP35396 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PpardP35396 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PpardP35396 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PpardP35396 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PpardP35396 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PpardP35396 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PpardP35396 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PpardP35396 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PpardP35396 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PpardP35396 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PpardP35396 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PpardP35396 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PpardP35396 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PpardP35396 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PpardP35396 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PpardP35396 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PpardP35396 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PpardP35396 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PpardP35396 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PpardP35396 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PpardP35396 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PpardP35396 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PpardP35396 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PpardP35396 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PpardP35396 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PpardP35396 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PpardP35396 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PpardP35396 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PpardP35396 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PpardP35396 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpardP35396 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpardP35396 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpardP35396 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpardP35396 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpardP35396 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpardP35396 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpardP35396 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpardP35396 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpardP35396 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpardP35396 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpardP35396 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpardP35396 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpardP35396 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpardP35396 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpardP35396 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PpardP35396 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PpardP35396 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PpardP35396 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PpardP35396 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PpardP35396 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PpardP35396 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PpardP35396 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PpardP35396 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PpardP35396 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PpardP35396 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpardP35396 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpardP35396 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpardP35396 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpardP35396 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpardP35396 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpardP35396 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PpardP35396 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpardP35396 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpardP35396 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PpardP35396 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpardP35396 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpardP35396 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpardP35396 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpardP35396 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpardP35396 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
PpardP35396 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpardP35396 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpardP35396 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpardP35396 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpardP35396 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpardP35396 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PpardP35396 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PpardP35396 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms