Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rab5cP35278 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rab5cP35278 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rab5cP35278 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rab5cP35278 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rab5cP35278 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rab5cP35278 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rab5cP35278 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rab5cP35278 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rab5cP35278 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rab5cP35278 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Rab5cP35278 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab5cP35278 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab5cP35278 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rab5cP35278 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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