Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rab3dP35276 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3dP35276 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3dP35276 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3dP35276 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3dP35276 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3dP35276 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3dP35276 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3dP35276 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3dP35276 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3dP35276 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3dP35276 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3dP35276 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3dP35276 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3dP35276 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3dP35276 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3dP35276 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rab3dP35276 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms