Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoc3P33622 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms